Saab AB
Kunskapsskolans Naturvetenskapliga Centrum har sedan 2008 ett samarbetsavtal med Saab AB där Saab bidrar ekonomiskt för att säkra en hög nivå på centrumets laborationssalar samt tillgång till avancerad laborationsutrustning. Samarbetet kommer exempelvis också att inrymma möjlighet till mentorskap (inom ramen för Saabs Industridoktorandprogram) samt praktikplatser och studiebesök på Saabs anläggningar. Saab kommer att ha en plats i det blivande KNC-rådet där även representanter för andra samarbetspartners kommer att ingå.  

Saab har för sin framtida rekrytering av ingenjörer ett stort intresse i att det utbildas fler elever inom naturvetenskap och teknik, att utbildningarna förnyas med spännande tillämpningar som skapar intresse, samt att lärarna har aktuell kompetens.

Förbundet Unga Forskare (FUF)
Genom samarbete med Förbundet Unga Forskare (FUF) ges intresserade gymnasieelever möjlighet att delta i projekttävligen Utställningen Unga Forskare. Tävligen inleds med regionala deltävlingar runtom i landet, där Kunskapsgymnasiet är en helt egen "region". (Anmälan görs till KNC senast måndag 1 feb. 2010).

Regionfinalen för Kunskapsgymnasiet, där de tio bästa  bidragen från alla Kunskapsgymnasierna deltar, äger rum måndagen den 15 mars 2010 på Kunskapsskolans Naturvetenskapliga Centrum i Saltsjöbaden. Övriga regionfinaler äger rum i Göteborg, Halmstad, Kalmar, Karlshamn, Linköping, Luleå, Malmö, Stockholm, Sundsvall, Umeå och Växjö.

Vinnarna i respektive region bjuds in till den nationella utställningen på Tekniska Museet i Stockholm där de nationella vinnarna belönas med prestigefyllda stipendier till exempelvis den stora utställningen Intel International Science & Engineering Fair (ISEF) i USA eller sommarforskarläger vid MIT i Boston. Totalt delar  Förbundet Unga Forskare ut stipendier för ungefär en halv miljon kronor.

Blivande samarbetspartner
Diskussioner kring kommande samarbeten mellan KNC och andra aktörer pågår löpande. Ett exempel är DreamHack som bland annat arrangerar stora datorfestivaler och digitala communities för onlinespel.